ฝ่ายส่งน้ำและบำรุงรักษาที่ 5 มีหน้าที่รับผิดชอบในการควบคุม ดูแลการส่งน้ำและบำรุงรักษาโครงการชลประทานขนาดกลางโครงการชลประทานขนาดเล็ก โครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริในเขตพื้นที่รับผิดชอบ ร่วมวางแผนให้คำแนะนำด้านการบริหารจัดการน้ำให้แก่โครงการชลประทานราษฎร์ในพื้นที่ และดำเนินการซ่อมแซม-ปรับปรุงระบบชลประทานในพื้นที่รับผิดชอบให้สามารถใช้การได้อย่างมีประสิทธิภาพ รวมทั้งประสานงานกับอำเภอ องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น และเกษตรกรในการพิจารณาแก้ไขปัญหาด้านการจัดสรรน้ำ งานพัฒนาแหล่งน้ำต่าง ๆ ที่อยู่นอกเขตโครงการส่งน้ำและบำรุงรักษา และจัดตั้งกลุ่มผู้ใช้น้ำและฝึกอบรมเกษตรกรให้มีความรู้เรื่องการใช้น้ำอย่างถูกวิธี ซึ่งฝ่ายส่งน้ำและบำรุงรักษาที่ 5 แบ่งงานภายในออกเป็น 3 งาน ดังนี้
- งานส่งน้ำและส่งเสริมกิจกรรมต่อเนื่อง มีหน้าที่เกี่ยวกับการควบคุมดูแลการส่งน้ำ การระบายน้ำ การแก้ไขปัญหาขาดแคลนน้ำ การป้องกันอุทกภัยแก่พื้นที่การเกษตรในเขตความรับผิดชอบ ประสานงานกับอำเภอ องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น และเกษตรกรในการวางแผนการส่งน้ำชลประทานเพื่อการเกษตร และกิจกรรมอื่น ๆ รวมทั้งดำเนินการจัดตั้งกลุ่มผู้ใช้น้ำ ฝึกอบรมเกษตรกรให้มีความรู้เรื่องการใช้น้ำอย่างถูกวิธี
- งานปฏิบัติการ มีหน้าที่เกี่ยวกับการปฏิบัติการแก้ไข การป้องกันอุทกภัยในพื้นที่ ดำเนินการปรับปรุงระบบชลประทาน ปรับปรุงพัฒนาแหล่งน้ำต่าง ๆ ในพื้นที่
- งานซ่อมแซมและบำรุงรักษา มีหน้าที่เกี่ยวกับการวางแผนงานซ่อมแซมและดูแลบำรุงรักษาระบบส่งน้ำ ระบบระบายน้ำ และอาคารต่าง ๆ ในพื้นที่
